Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP89Q96ST8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms