Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms