Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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