Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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