Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms