Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms