Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms