Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms