Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD247P20963 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD247P20963 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms