Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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