Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2B1P20020 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms