Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms