Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN2P17655 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN2P17655 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN2P17655 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN2P17655 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms