Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DMDP11532 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DMDP11532 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms