Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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