Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms