Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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