Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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