Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms