Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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