Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NESP48681 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NESP48681 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NESP48681 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms