Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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