Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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