Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms