Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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