Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms