Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms