Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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