Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNA2P51530 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNA2P51530 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms