Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 AC022392.1-201ENST00000609403 744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NESP48681 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NESP48681 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NESP48681 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NESP48681 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NESP48681 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms