Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINC1P01008 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms