Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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