Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms