Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms