Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms