Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms