Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6P435 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6P435 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6P435 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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