Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NFIB-206ENST00000397575 2869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PIGO-201ENST00000298004 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CR769775.4-201ENST00000638516 4139 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ADAMTSL1-201ENST00000276935 2906 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BTBD18-202ENST00000436147 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AP3B2-202ENST00000535348 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TCP11L1-202ENST00000432887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL031733.2-201ENST00000451992 2523 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TRPV5-201ENST00000265310 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CDKL2-202ENST00000429927 3383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TKTL1-201ENST00000369912 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CASP7-204ENST00000369321 2620 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 STPG1-201ENST00000003583 2544 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC008543.5-201ENST00000589227 2515 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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