Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ALOXE3-203ENST00000448843 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TRPM3-207ENST00000377101 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ARMC8-221ENST00000491704 2777 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 GPR155-201ENST00000295500 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MS4A14-209ENST00000531787 2537 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC068282.1-201ENST00000433673 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 RPH3A-219ENST00000551052 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PAMR1-207ENST00000619888 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC022148.1-201ENST00000316807 3267 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ADGRG5-201ENST00000340339 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 RSPH3-203ENST00000449822 1904 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MAPK10-203ENST00000361569 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MAPK10-255ENST00000641020 2412 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TDGF1-201ENST00000296145 2513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SERPINA10-203ENST00000554173 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 A2M-AS1-201ENST00000499762 2192 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SCN5A-206ENST00000425664 8450 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CREB3L4-205ENST00000368607 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CLEC4M-202ENST00000327325 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 LINC01854-201ENST00000375987 2213 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 NID2-201ENST00000216286 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 OPRM1-204ENST00000360422 1737 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 NKIRAS2-205ENST00000393881 1598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PCP4P48539 H2AFZP1-201ENST00000416034 395 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms