Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MS4A6E-201ENST00000300182 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 POLR3KP1-201ENST00000449146 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HOXB1P14653 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HOXB1P14653 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC01739-204ENST00000641712 1005 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HOXB1P14653 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HOXB1P14653 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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