Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 CHN2-209ENST00000421775 825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AP000553.1-201ENST00000610143 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CC2D2AQ9P2K1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 CD300A-201ENST00000310828 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL137785.1-201ENST00000637466 490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL353807.2-201ENST00000456382 220 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CC2D2AQ9P2K1 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms