Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms