Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms