Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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