Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms