Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms