Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPIBQ01892 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms