Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms