Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms