Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.8 ms